新農村一體化污水處理設備去除有機污染物及氨氮主要依賴于設備中的AO生物處理工藝。其中工作原理是在A級，由于污水有機物濃度很高，微生物處于缺氧狀態，此時微生物為兼性微生物，所以A級池不僅具有一定的有機物去除功能，減輕后續好氧池的有機負荷，有機物濃度降低，但仍有一定量的有機物及較高NH3-N存在。

農村農民居住集中程度不及城市，生活污水產生強度低于城市，應當鼓勵采用經濟、簡易、有效、盡可能與當地農業生產相結合的多樣化農村污水處理設備技術，實現污水的無害化處理和資源化利用。